Fundado pela Irmandade do Senhor Bom Jesus do Bonfim no ano de 1975 e instalado nos corredores da Basílica, seu acervo se consitui de objetos de cera, prata, ouro, madeira, etc, oferecidos pelos fiéis, em pagamento de graças alcançadas. A devoção do Senhor do Bonfim remonta aos meados do século XVIII e foi introduzida na Bahia pelo mesmo Capitão Teodósio Rodrigues de Faria, que trouxe de Portugal uma imagem do Crucificado.